Früher Teil der mittelalterlichen Wehranlage Jenas, die aus Mauern mit Wehrgang, Gräben, Toren, Ecktürmen und Rondellen bestand
Entstehung von Johannistor und Pulverturm zeitgleich mit der beginnenden Befestigung Jenas in der zweiten Hälfte des 13. Jahrhunderts, nachdem die Lobdeburger Jena das Stadtrecht verliehen hatten
Laut einer bei Bauarbeiten im Jahr 1816 gefundenen Inschrift wurde das Ensemble 1304 fertiggestellt; erste urkundliche Erwähnung 1305
Fünfgeschossige, quadratische Toranlage aus Werkstein
Im Erdgeschoss spitzbogige Toröffnungen, die im Inneren in eine kreuzgratgewölbte Halle führen
Über dem westlichen Toreingang befindet sich ein Balkon, genannt „Käsekorb“; laut einer Legende sollen hier „besonders zänkische, unzüchtige und diebische Weibsbilder“ zur Schau gestellt worden sein; in Wirklichkeit wohl Ausguck für Torwächter
Darüber befindet sich eine Plattform mit Steinbrüstung und Entwässerungsrohren, die an den Ecken mit Wasserspeiern enden
Name des Johannistores ergibt sich aus der an das Ensemble angrenzenden Johannisvorstadt, die ihren Namen wiederum von der dort stehenden Johanniskirche bekam (heute katholische Kirche oberhalb der Wagnergasse)
Das Johannistor war Teil der Wehranlage, besaß aber auch eine handels- und verkehrstechnische Funktion; dort wurde der Handelsverkehr auf der Ost-West-Achse kontrolliert
Im Hofraum der Doppeltoranlage siedelte sich Handwerk an
Nach dem 30-jährigen Krieg verloren derartige Befestigungsanlagen immer mehr an Bedeutung und wurden im 18. und 19. Jahrhundert umgestaltet oder abgetragen (so z.B. das Saaltor 1844)
1430/31 wurde der Turm umgebaut und erweitert, die Gräben gereinigt und die Mauern verstärkt
Anfang des 19. Jahrhunderts wurden die Wassergräben verfüllt
1816 und 1957 erfolgten Reparaturarbeiten
1977/78 kam es zu Konservierungsarbeiten im Zuge der Umgestaltung des gesamten Stadtmauerbereichs zwischen Johannistor und Pulverturm in eine Fußgängerzone
1985 wurde ein Verbindungsgang zum neu errichteten Haus auf der Mauer gebaut (nachdem das alte abgerissen worden war)
2000/01 wurde eine Gesamtsanierung vorgenommen
Instandsetzung von Mauerwerk, Witterungsschutz und Oberflächen